超微结构 

电镜下，菌体的一端可见4~7条带鞘的鞭毛。分裂时，则两端均可见鞭毛。鞭毛长度约为菌体长径的1.0~1.5倍，直径约为30nm。每一鞭毛根部均可见一圆球状根基，位于菌体细胞壁内侧，每一鞭毛由此向菌体外伸出。菌体末端鞭毛根基的内侧，尚有一个明显的低电子密度区域，可能与鞭毛运动的能量储存有关。

鞭毛的鞘是一层含有蛋白和脂多糖的膜，鞘的作用可能是保护鞭毛免于胃酸的侵袭。 鞭毛含有两种不同的鞭毛蛋白：FlaA和FlaB，这两种鞭毛蛋白对于细菌的运动均是必需的。

鞭毛是Hp的动力器官，在定居过程中起“锚着"的作用[3]。

鞭毛蛋白的表达受基因fliP中某些重复序列的调节，从而使得Hp从有动力向无动力转化，而这种转变是可逆的，提示在Hp中存在一种调控细菌动力的机制[4]。

Hp经鞣酸处理，可见包裹其外表面、厚达40nm的糖萼（glucocalyx）。电镜下，由于其呈细丝网状与胃黏膜上皮细胞表面连接，因此亦有人称之为纤毛或菌毛，它成为黏附于胃上皮细胞表面的主要物质基础。Hp定居于胃上皮细胞表面，除了鞭毛和菌毛的作用以外，尚存在菌体细胞壁与胃上皮细胞细胞膜表面直接相贴的现象。这种现象的机理可能与借糖萼黏连的机理不同，其机理及其是否有特殊意义有待进一步研究。Hp与人红细胞Lewis分型中Leb型红细胞发生凝集，电镜下亦可见到上述两种类似的相互黏附现象。