幽门螺旋杆菌的克拉霉素耐药菌株和敏感菌株的肌氨酸不溶型外膜蛋白的比较蛋白组学分析
人类幽门螺旋杆菌相关的疾病包括慢性消化性溃疡、胃癌以及淋巴组织淋巴瘤。幽门螺旋杆菌克拉霉素耐药率的升高进一步导致了这些疾病发病率的升高。一篇2013年10月发表于Journal of microbiology杂志来自于美国德州的研究针对其他的革兰阴性菌对抗生素的耐药机制涉及外膜蛋白（OMP）的修饰这一特点，使用比较蛋白组学的方法来对幽门螺旋杆菌克拉霉素耐药菌株和敏感菌株的OMP进行分析。幽门螺旋杆菌的克拉霉素耐药菌株和敏感菌株的肌氨酸不溶型外膜蛋白的比较蛋白组学分析步骤如下：1）凝胶电泳蛋白质分离；2）使用基质辅助激光解吸电离质谱分析法进行凝胶分离的蛋白质的消化和质谱分析。研究发现在克拉霉素耐药的菌株中，铁调控膜蛋白、脲酶B、延伸因子EF-Tu，以及假定的OMP发生表达下调；HopT (BabB) 跨膜蛋白，HofC，OMP31发生表达上调。此后，通过使用Western blotting 与real time PCR两种技术手段分别验证发现：脲酶B的蛋白亚基以及EF-Tu的改变是发生在蛋白水平的，而HofC和HopT的表达调节则发生在mRNA表达阶段。这项蛋白质组学的研究证明了外膜蛋白的表达谱的改变可能是幽门螺杆菌出现克拉霉素耐药的新机制。
资料来源：
Smiley R, Bailey J, Sethuraman M, Posecion N, Showkat Ali M. Comparative proteomics analysis of sarcosine insoluble outer membrane proteins from clarithromycin resistant and sensitive strains of Helicobacter pylori.J Microbiol. 2013 Oct;51(5):612-8. doi: 10.1007/s12275-013-3029-5. Epub 2013 Oct 31.