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段本松
段本松
上海市东方医院

 

    在不同的地理区域,由于进化受到地理因素的影响,幽门螺旋杆菌基因型也是不尽相同。在一些幽门螺旋杆菌传染性高国家,比如印度,人们之前还未对未幽门螺旋杆菌完整基因组进行过分析。因此,此次对印度的两种幽门螺旋杆菌分型NAB47和NAD1进行的基因测序具有重大的研究意义。研究过程中,该项研究进行了基因测序和测序的分析,基于下游统计的基因组组装,以及记录了两种基因组草图的重要特点,其中包括它们的系统发育情况。该研究认为基因序列和比较基因组方面的研究结果会帮助我们进一步认识印度幽门螺旋杆菌的生物学起源和特点。更重要的是这一研究可能有助于解决印度幽门螺旋杆菌流行现状的一个怪异现象:印度的幽门螺旋杆菌已被证实为高传染率,但印度幽门螺旋杆菌的感染者却很少发展演变为与其相关的严重疾病,如胃癌。对这一流行现象机制的研究将有利于我们更深层次理解幽门螺旋杆菌的致病机理。

 

 

资料来源:

Kumar N, Mukhopadhyay AK, Patra R, et al. Next-generation sequencing and de novo assembly, genome organization, and comparative genomic analyses of the genomes of two Helicobacter pylori isolates from duodenal ulcer patients in India. J Bacteriol, 2012, 194: 5963-5964.